漢朝，因地處牟山之陽平緩地而得名。

漢初（公元前206年），于今縣境設(shè)東牟縣，為青州東萊郡隸。東漢建武五年（29）平齊地后，廢弘德縣，復(fù)名東牟縣。永平二年（59），割東萊郡東牟等縣入瑯琊國。三國時魏仍設(shè)東牟縣，青州東萊郡隸。晉初（265）撤東牟縣，以其地并入治所在今福山區(qū)的牟平縣。東晉未至南朝劉宋初年，一度為甫朝政權(quán)收復(fù)，旋又淪為北魏。在此期間，今牟平縣地先屬治在今福山區(qū)的牟平縣，繼屬治在今黃縣境的牟平縣（《太平寰宇記》謂在黃縣東七十三里，馬嶺山南）。北齊天統(tǒng)四年（568）分牟平縣地置文登縣后，今縣地改屬光州文登縣。隋統(tǒng)一后，今牟平縣地仍屬文登縣，惟文登縣改隸萊州，后又更為隸東萊郡。唐初，今牟平縣地仍屬文登縣。武德四年（621）于文登縣置登州，貞觀元年（627）州廢縣存。貞觀二年，省設(shè)治于今黃縣境的牟平縣。麟德二年（665）分文登縣地復(fù)置牟平縣，治漢東牟縣城，即今縣治，是為漢牟平縣名，移至漢東牟縣，即今縣之始，亦為今縣地定設(shè)牟平縣治之始。如意元年（692）重設(shè)登州于黃縣境，后移治蓬萊縣，牟平縣隸屬不變。天寶元年（742）登州改名東牟郡。乾元元年（758）復(fù)稱登州?！　∥宕了危卦O(shè)牟平縣及登州。宋時登州又別稱東牟郡，屬京東路?！　　熬缚抵儭焙?，金扶立劉豫偽齊傀儡政權(quán)，京東路地為齊所轄。齊阜昌二年（1131），于登州牟平縣治，別置寧海軍。阜昌八年（1137），金廢齊，寧海軍為金直接統(tǒng)治。　　金大定二十二年（1182），升寧海軍為寧海州，治所仍在牟平縣，轄牟乎、文登二縣，山東東路隸?！　≡卦O(shè)寧海州，仍治于牟平縣城，轄牟平、文登二縣。初隸于益都路，繼隸于淄萊路，至元九年直隸于中書省。明洪武元年（1368），以牟平縣省人寧海州，僅轄文登縣，州治不變，但改隸于萊州府。洪武九年復(fù)登州府，寧海州隸。萊州、登州初屬山東行中書省，繼屬山東承宣布政使司。清時（1644-l911），沿襲明建置。1914年，改稱牟平縣。1994年7月2日，撤銷牟平縣，設(shè)立牟平區(qū)和萊山區(qū)。1992年4月25日，撤銷牟平縣武寧鄉(xiāng)、大窯鄉(xiāng)、龍泉鄉(xiāng)、莒格莊鄉(xiāng)，分別設(shè)立武寧鎮(zhèn)、大窯鎮(zhèn)、龍泉鎮(zhèn)、莒格莊鄉(xiāng)，分別設(shè)立武寧鎮(zhèn)、大窯鎮(zhèn)、龍泉鎮(zhèn)、莒格莊鎮(zhèn)。1992年12月26日，撤銷牟平縣玉林店鄉(xiāng)、院格莊鄉(xiāng)、埠西頭鄉(xiāng)，分別設(shè)立玉林店鎮(zhèn)、院格莊鎮(zhèn)、埠西頭鎮(zhèn)。。1996年5月24日，撤銷牟平區(qū)王格莊鄉(xiāng)、劉家夼鄉(xiāng)，設(shè)立王格莊鎮(zhèn)、劉家夼鎮(zhèn)（魯政函民字[1996]24號）。1998年底，全區(qū)轄15鎮(zhèn)，即埠西頭鎮(zhèn)、觀水鎮(zhèn)、院格莊鎮(zhèn)、寧海鎮(zhèn)、養(yǎng)馬島鎮(zhèn)、大窯鎮(zhèn)、姜格莊鎮(zhèn)、玉林店鎮(zhèn)、莒格莊鎮(zhèn)、龍泉鎮(zhèn)、水道鎮(zhèn)、劉家夼鎮(zhèn)、王格莊鎮(zhèn)、高陵鎮(zhèn)、武寧鎮(zhèn)，共608個行政村。