光緒31年（1905年），一度設(shè)立江淮省，巡撫駐淮安，即省會所在地，后旋即撤裁。

民國二年（1913年），廢府存縣，淮安府撤銷，次年，山陽縣改名淮安縣，清河縣改名淮陰縣。后今淮安市境大部屬淮揚道（道署設(shè)今淮安市區(qū)），后屬淮陰行政督察區(qū)、第七行政督察區(qū)。

抗日戰(zhàn)爭和解放戰(zhàn)爭時期，境內(nèi)成為重要的根據(jù)地和解放區(qū)，中共中央華中局、新四軍軍部、中共中央華中分局、華中軍區(qū)、蘇皖邊區(qū)政府等都曾駐節(jié)境內(nèi)。由于處在敵后環(huán)境，根據(jù)地和解放區(qū)的政區(qū)變化很大，頭緒繁多，大抵分屬淮海區(qū)、鹽阜區(qū)、淮南區(qū)、淮北區(qū)。

抗戰(zhàn)勝利后至1946年9月的一年間，淮安是華中解放區(qū)的中心、蘇皖邊區(qū)的首府，時蘇皖邊區(qū)南界長江、北界隴海鐵路、東至黃海、西至裕溪口一線，橫跨蘇皖豫魯四省之境，轄53個舊縣。

1948年12月，市境全部解放。

1949年，成立淮陰專區(qū)，轄淮陰、淮寶（由原淮安、寶應(yīng)兩縣運河以西的部分地區(qū)所組成，縣人民政府駐岔河鎮(zhèn)）、泗陽、沭陽、灌云、宿遷、睢寧、新安（由原沭陽、宿遷兩縣的一部分地區(qū)所組成，縣人民政府駐新安鎮(zhèn)）、邳?。ㄓ稍h隴海路南及睢寧縣北部地區(qū)所組成，縣人民政府駐土山鎮(zhèn)）、漣水10縣。專員公署駐淮陰縣。

1950年，鹽城專區(qū)漣東縣并入淮陰專區(qū)漣水縣；撤銷淮寶縣，分別并入淮陰、淮安和揚州專區(qū)的寶應(yīng)3縣；淮陰縣城設(shè)立清江市；淮陰專區(qū)轄1市9縣。

1953年1月蘇南、蘇北行署與南京市合并恢復(fù)江蘇省，淮陰專區(qū)屬江蘇省領(lǐng)導(dǎo)，專署駐清江市。同年，睢寧、邳睢、新沂3縣劃歸徐州專區(qū)。

1954年，淮安縣從鹽城專區(qū)劃歸淮陰專區(qū)；同年12月，原屬安徽省宿縣專區(qū)的泗洪縣，滁縣專區(qū)的盱眙縣劃入淮陰專區(qū)，轄9縣。

1970年，淮陰專區(qū)改稱淮陰地區(qū)，專署駐清江市。

1971年，六合地區(qū)所屬盱眙縣、金湖縣2個縣劃入淮陰地區(qū)，轄1市12縣。

1983年，清江市更名為淮陰市，改由省直轄，撤銷淮陰地區(qū)。市區(qū)設(shè)清河區(qū)、清浦區(qū)2個區(qū)，將漣水縣、洪澤縣、盱眙縣、金湖縣、灌南縣、沭陽縣、宿遷縣、泗陽縣、泗洪縣、淮陰縣、淮安縣11個縣劃歸淮陰市領(lǐng)導(dǎo)，轄2區(qū)11縣。同時將灌云縣劃歸連云港市領(lǐng)導(dǎo)。

1987年，淮安縣、宿遷縣改為縣級市。

1996年8月，宿遷市、沭陽縣、泗陽縣、泗洪縣4個縣市從淮陰市析出，成立地級宿遷市。同時將灌南縣劃入連云港市。

2001年，江蘇省政府實施“三淮一體”戰(zhàn)略，地級淮陰市更名為淮安市，縣級淮安市更名為淮安市楚州區(qū)，淮陰縣更名為淮安市淮陰區(qū)。

2012年，淮安市楚州區(qū)更名為淮安區(qū)。

2016年，淮安市清河區(qū)、清浦區(qū)合并更名為清江浦區(qū)，洪澤縣更名為淮安市洪澤區(qū)。

至此，淮安市下轄4區(qū)3縣：清江浦區(qū)、淮陰區(qū)、淮安區(qū)、洪澤區(qū)、漣水縣、盱眙縣、金湖縣。