下列貨物免征增值稅:批發(fā)和零售的種子、種苗、化肥、農(nóng)藥、農(nóng)機。 也就是說農(nóng)機在農(nóng)機生產(chǎn)廠出廠銷售時，按13％的稅率征稅。各級、各類農(nóng)機經(jīng)銷機構(gòu)（企業(yè)）將從生產(chǎn)廠購進的農(nóng)機再銷售時，是免征增值稅的。也就是在農(nóng)機生產(chǎn)環(huán)節(jié)征收增值稅，銷售環(huán)節(jié)免征增值稅。

為什么農(nóng)機銷售公司要交銷售額的千分之三的稅?

財政部、國家稅務(wù)總局財稅字［1996］018號文件規(guī)定，對飼料、農(nóng)膜、化肥、農(nóng)藥、農(nóng)機、種子、種苗等農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料免征增值稅。但對農(nóng)機有明確的界定，不能一概而論。對一般納稅人來說，農(nóng)機經(jīng)營免稅，即適用13%的稅率。部門不免稅的適用17%的稅率。對小規(guī)模納稅人來說，手續(xù)齊全，申請報批的免稅。有部門不免稅的，適用3%的征收率。你說的千分之三是什么稅，應(yīng)當沒有這樣的稅率。

銷售農(nóng)產(chǎn)品的商貿(mào)企業(yè)適用稅率問題

根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于部分貨物適用增值稅低稅率和簡易辦法征收增值稅政策的通知》規(guī)定：
一、下列貨物繼續(xù)適用13%的增值稅稅率：
（一）農(nóng)產(chǎn)品。農(nóng)產(chǎn)品，是指種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、林業(yè)、牧業(yè)、水產(chǎn)業(yè)生產(chǎn)的各種植物、動物的初級產(chǎn)品。” 根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)的通知》（財稅字〔1995〕52號）規(guī)定： “農(nóng)業(yè)產(chǎn)品是指種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、林業(yè)、牧業(yè)、水產(chǎn)業(yè)生產(chǎn)的各種植物、動物的初級產(chǎn)品。農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的征稅范圍包括： 二、動物類 …… （二）畜牧產(chǎn)品 2.獸類、禽類和爬行類動物的肉產(chǎn)品，包括整塊或者分割的鮮肉、冷藏或者冷凍肉、鹽漬肉，獸類、禽類和爬行類動物的內(nèi)臟、頭、尾、蹄等組織。 各種獸類、禽類和爬行類動物的肉類生制品，如臘肉、腌肉、熏肉等，也屬于本貨物的征稅范圍。 各種肉類罐頭、肉類熟制品，不屬于本貨物的征稅范圍。” 所以應(yīng)該是適用于13%.

甲公司屬于增值稅一般納稅人，2015年2月銷售機器設(shè)備900萬元，同時又經(jīng)營農(nóng)機收入200萬元。甲

一般是分別核算更好。因為批發(fā)零售農(nóng)機是免稅的。如果不分開核算，都必須按17%的稅率計算銷項稅額。
分別核算：銷項稅額=900萬元×17%，進項但只有機器設(shè)備900萬元的進項可以抵扣。
不分別核算：銷項稅額=（900+200）萬元×17%，進項稅額兩者都可以抵扣。
所以，一般情況下是分開核算比較劃算，交的增值稅少。但如果農(nóng)機銷售價小于進貨價，不分別核算可以多抵扣，就另當別論了。