但是，由于我國“三農(nóng)”工作的歷史和現(xiàn)實所局限，農(nóng)機專業(yè)合作社乃至農(nóng)民專業(yè)合作社的運作當中，目前還存在幾個具體問題，值得探討。設(shè)備資源的所有者與經(jīng)營者分離，難以實現(xiàn)設(shè)備資源的合理利用與有效保護農(nóng)民專業(yè)合作社在組建與運作當中，有部分農(nóng)民是以資金形式入股，有很大部分農(nóng)民是以設(shè)備資源（農(nóng)機具設(shè)備、土地資源）的形式入社的，社員將設(shè)備資源投入合作社，由合作社來經(jīng)營，社員獲得分紅，社員仍是設(shè)備資源的所有者，而合作社則是設(shè)備資源的經(jīng)營者，雖然合作社采取民主管理，但是在具體操作當中，不可能每位社員的經(jīng)營意愿都能夠滿足，這就是說合作社的經(jīng)營者只能采取民主集中的方式來經(jīng)營，也就是說，在某種程度上設(shè)備資源的所有者與經(jīng)營者是分離的。正是由于這個分離，就可能使社員投入的設(shè)備資源難以得到合理的利用與有效的保護。一個簡單的例子，如農(nóng)民以農(nóng)機具入社，在農(nóng)機具的養(yǎng)護當中，合作社認為是農(nóng)戶的機具，應該由農(nóng)戶養(yǎng)護；而農(nóng)戶則認為將機具入社，應該由合作社負責。農(nóng)機作業(yè)服務面積的計量誤差，造成合作社服務成本的增加與服務風險的增大目前農(nóng)民專業(yè)合作社在對合作社內(nèi)部開展作業(yè)服務的同時，也向外開展作業(yè)服務，包括跨區(qū)作業(yè)。在作業(yè)服務的過程當中，土地面積的確定，一般都是依據(jù)“土地承包手冊”合同書上的耕地面積，而這個土地承包合同書還是上世紀八十年代初期的產(chǎn)物，加之各地在承包到戶時存在根據(jù)土地類別打折等情況，雖然這其中經(jīng)歷了幾次合同完善與核對面積，但是，合同書上體現(xiàn)的面積往往與實際面積不符，而且實際面積比合同書上的面積要大，這就造成了合作社在作業(yè)服務過程中的作業(yè)成本增加和服務量增大。例如機械化植保統(tǒng)防統(tǒng)治的作業(yè)服務，合作社在前期與農(nóng)戶簽訂作業(yè)服務合同，為調(diào)動農(nóng)戶機械化植保統(tǒng)防統(tǒng)治的積極性，合作社作出如實現(xiàn)不了防治效果，則按損失賠償?shù)某兄Z，而在具體防治與作業(yè)服務當中，則按農(nóng)戶提供的面積進行配藥施藥，由于面積的誤差，可能達不到防治效果，就出現(xiàn)了合作社要賠償?shù)暮蠊＾r(nóng)機專業(yè)合作社的發(fā)展壯大與現(xiàn)實條件存在差異實現(xiàn)合作社的發(fā)展壯大，是農(nóng)民專業(yè)合作社目的之一。但是，這方面的意愿與現(xiàn)實條件存在差異。一是農(nóng)民專業(yè)合作社融資難?，F(xiàn)在農(nóng)業(yè)機械動輒上萬，雖然國家有一定補貼，但是資金占用量還是比較大，合作社要發(fā)展壯大，必須要資金添置機具設(shè)備，而合作社的融資渠道只有兩條，一是農(nóng)戶股金（這是有限的），二是貸款（這是很有限度的），可是這兩條渠道都難以滿足發(fā)展的需要。二是作業(yè)條件改善難。農(nóng)民專業(yè)合作社的作業(yè)服務，社會化大生產(chǎn)是方向，而我國目前實行的土地家庭聯(lián)產(chǎn)承包為主體，統(tǒng)分結(jié)合的雙層經(jīng)營體制已經(jīng)將土地承包到戶，雖然土地流轉(zhuǎn)政策將土地的集約化程度提高，土地整理將土地的機械化作業(yè)條件改善，但是這些還只是示范性的，農(nóng)田水利基本建設(shè)的條件并未完全從根本上得到全面改善，要實現(xiàn)農(nóng)民專業(yè)合作社的社會化大生產(chǎn)，作業(yè)條件的改善，還有大量的工作要做。三是管理、技術(shù)、服務水平提升難。雖然政府出臺了各項政策鼓勵和發(fā)展農(nóng)民專業(yè)合作社，要增強合作社的凝聚力、吸引力、感召力，但是，如何來增強，具體怎么做，卻沒有答案。而目前農(nóng)民專業(yè)合作社運作的實際是：1.依托基層農(nóng)業(yè)站所、經(jīng)濟組織，組織一些農(nóng)戶，投入一些資金，搞一點經(jīng)營。2.依托農(nóng)機大戶，聚合一些機具，搞一些服務。3.依托公司或者老板，流轉(zhuǎn)一些土地，搞一些開發(fā)。4.依托農(nóng)戶熱情，組成一個班子，自生自滅。因此，在這種情況下，要使管理、技術(shù)、服務的水平提升上來，是很難的。綜上所述，筆者認為，要實現(xiàn)農(nóng)民專業(yè)合作社的健康發(fā)展，應該做好以下幾個方面的具體工作。農(nóng)民專業(yè)合作社應制定詳細的內(nèi)部管理法并實施。雖然目前合作社有章程、管理制度等等，但是往往是形式上的。合作社應該根據(jù)自身實際，制定詳細、實用的內(nèi)部管理法，既保證集體的權(quán)力得到尊重，又保證社員的利益不被侵害，這些制度和管理法要由合作社來做。土地面積應該核實。誠然有歷史的原因存在土地面積誤差，但近年來的基本建設(shè)（農(nóng)業(yè)的和非農(nóng)業(yè)的、公益的和非公益的）也使土地面積存在計量不準的事實，應該在條件允許的范圍內(nèi)進行核實，這是一個系統(tǒng)工程，牽涉到按土地面積計算的各種利益關(guān)系、統(tǒng)計數(shù)據(jù)等等，這項工程應該由政府來做。加強農(nóng)民專業(yè)合作社的培育與扶持。要改善農(nóng)民專業(yè)合作社的作業(yè)服務條件，加大扶持與培育力度，特別要加強對農(nóng)民專業(yè)合作社的管理與引導。