農(nóng)業(yè)機械工程系前身為石河子農(nóng)學(xué)院農(nóng)機系，始建于1959年， 2001年大學(xué)進行院系調(diào)整，成立石河子大學(xué)機械電氣工程學(xué)院農(nóng)業(yè)機械教研室，2008年學(xué)院根據(jù)學(xué)科發(fā)展進行了系部調(diào)整，成立了農(nóng)業(yè)機械工程系。
農(nóng)業(yè)機械工程系現(xiàn)有教職工13人，其中教授3人，副教授5人；博士學(xué)歷3人，占教師總數(shù)的20%，碩士學(xué)歷10人，占教師比例的67%；碩士生導(dǎo)師6人，國務(wù)院特貼專家1人，校級“教學(xué)名師”1人，“263”骨干教師4個。2006年農(nóng)業(yè)機械工程系所黨支部被兵團、自治區(qū)評為先進基層黨組織。農(nóng)業(yè)機械工程系現(xiàn)擁有1個自治區(qū)重點學(xué)科“農(nóng)業(yè)機械化工程”，1個一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點，2個專業(yè)碩士授權(quán)領(lǐng)域，1個教育部工程研究中心，3個省部級實驗測試中心，1門省級精品課程，7個專業(yè)研究室，教學(xué)科研儀器設(shè)備總值達到1200萬元。主持完成的科研項目獲省部級科技進步獎5項，教學(xué)成果獎2項。主持國家支撐計劃項目3項、國家自然科學(xué)基金項目5項，國家農(nóng)業(yè)成果轉(zhuǎn)化2項，農(nóng)業(yè)部和教育部項目5項，年均科研到位經(jīng)費200萬元以上。同時指導(dǎo)大學(xué)生在全國“挑戰(zhàn)杯”科技作品競賽中獲全國一等獎1項,二等獎2項,三等獎4項。 機械工程系的歷史可追溯到建院之初，2008年5月由機械電氣工程學(xué)院的機械設(shè)計教研室、機械制造教研室、工程圖學(xué)教研室合并成立；機械工程系設(shè)有1個本科專業(yè)和1個高職專業(yè)。2005獲得機械設(shè)計及理論，機械制造及自動化兩個碩士學(xué)位點。擁有機械原理、金相分析、機構(gòu)創(chuàng)新等本科教學(xué)實驗室7個；自治區(qū)級精品課程《工程制圖》1門，兵團級精品課程《機械制造基礎(chǔ)》1門、校級精品課程《機械設(shè)計基礎(chǔ)》1門，校級一類636f7079e799bee5baa6e79fa5e課程《數(shù)控技術(shù)》、《機械制造工藝學(xué)》、《人機工程學(xué)》3門；校級教學(xué)團隊《工程圖學(xué)》1個。
機械工程系擁有專職教師24人，其中教授4人，副教授9人；取得碩士學(xué)位18人（含在讀博士1人），取得博士學(xué)位4人；碩士生導(dǎo)師8人；“263”骨干教師11人。
主持863子課題2項，自然基金項目4項，國家科技支撐計劃項目子課題2項，省部級項目5項，發(fā)表EI論文14篇，取得實用新型專利13個。獲得兵團科技進步三等獎1項，農(nóng)八師科技進步二等獎1項。機械工程系堅持以教學(xué)為中心，不斷深化教學(xué)改革，近幾年來承擔(dān)各級各類教學(xué)改革項目30余項，多媒體課件制作項目20多項。獲得自治區(qū)教學(xué)成果二等獎1項，校級教學(xué)成果一等獎2項，三等獎5項；獲得全國多媒體課件大賽二等獎3項，三等獎2項，優(yōu)秀獎2項。編著國家級規(guī)劃教材4部，正式出版教材6部，校立教材12部。
機械工程系自成立以來，堅持以深入學(xué)習(xí)實踐科學(xué)發(fā)展觀為中心，積極進取，銳意創(chuàng)新，開展了豐富多彩的社會實踐活動。 2003年石河子大學(xué)機械電氣工程學(xué)院開始設(shè)置工業(yè)工程專業(yè)，并招收第一屆本科生，經(jīng)過五年的艱苦創(chuàng)業(yè)，辦學(xué)條件逐步完善，教學(xué)科研水平穩(wěn)步提高。為了適應(yīng)學(xué)科發(fā)展，學(xué)院進行系部調(diào)整，于2008年在原動力車輛教研室的基礎(chǔ)上成立了工業(yè)工程系，該系現(xiàn)有教師9人，其中，教授3人，副教授2人，講師2人，助教2人，具有博士學(xué)位教師1人，碩士5人（其中1人在讀）， “263”青年骨干教師1人。設(shè)有本科專業(yè)1個，擁有校級精品課程1門、一類課程1門、新專業(yè)資助建設(shè)課程1門，在校生150余人。
工業(yè)工程系以新興學(xué)科工業(yè)工程為主干，以機械工程和管理科學(xué)為基礎(chǔ)，以創(chuàng)新設(shè)計為重點，培養(yǎng)既具有堅實的工程技術(shù)基礎(chǔ)又掌握現(xiàn)代管理方法的復(fù)合型高級管理人才 —— 工業(yè)工程師。工業(yè)工程系開設(shè)的工業(yè)工程專業(yè)下設(shè)機械工程、電氣工程和管理工程三個方向。涉及的專業(yè)主干課程有：工程圖學(xué)、工程力學(xué)、電工電子學(xué)、機械設(shè)計基礎(chǔ)、機械制造基礎(chǔ)、機械控制工程、運籌學(xué)、系統(tǒng)工程、人機工程學(xué)、可靠性工程、質(zhì)量工程、工業(yè)工程基礎(chǔ)、管理信息系統(tǒng)、設(shè)施規(guī)劃與物流系統(tǒng)分析、生產(chǎn)計劃與控制、宏微觀經(jīng)濟學(xué)、管理學(xué)、計算機系列課程等。
工業(yè)工程系申請投入了近70萬的工業(yè)工程實驗室設(shè)備資金，改善了實踐教學(xué)條件。同時，努力提高教學(xué)理論水平，主持或參加校級教學(xué)改革項目3項，獲教學(xué)成果獎2項，指導(dǎo)SRP項目6項，發(fā)表教學(xué)論文10余篇。工業(yè)工程系全體教師積極承擔(dān)科研項目，近三年主持或參加省級以上課題5項，校級課題6項，院級課題3項；在各級學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表學(xué)術(shù)論文40多篇。
工業(yè)工程系在今后的發(fā)展中，將以加大人才引進力度，積極加強同國內(nèi)高校的學(xué)術(shù)交流與合作，通過派送教師外出進修學(xué)習(xí)或掛職，并邀請?zhí)旖虼髮W(xué)管理學(xué)院、重慶大學(xué)機械工程學(xué)院等國內(nèi)知名兄弟院校到該系開展學(xué)術(shù)交流，舉辦學(xué)術(shù)講座，有力地促進該系的專業(yè)建設(shè)與學(xué)科發(fā)展。 石河子大學(xué)機械電氣工程學(xué)院于1999年8月設(shè)立電氣工程及其自動化專業(yè)。于2008年9月成立電氣工程系，設(shè)有電力系統(tǒng)自動化和電氣自動化2個教研室。設(shè)有農(nóng)業(yè)電氣化及自動化碩士點及電氣工程及其自動化本科專業(yè)，畢業(yè)生就業(yè)率達到98%以上。
電氣工程系現(xiàn)有教師14人，教授1人，副教授4人，碩士生導(dǎo)師2人，在讀博士1人。獲“263”青年骨干教師培養(yǎng)計劃資助2人；一類課程3項，教學(xué)成果獎一等獎1項。主持國家自然科學(xué)基金項目1項，省部級科研項目2項，校級研究項目20余項。公開發(fā)表教研、科研論文50余篇，出版學(xué)術(shù)專著5部。
電氣工程系現(xiàn)有實驗室面積近近1000平米，擁有較完備的供教學(xué)與科研用基礎(chǔ)性實驗設(shè)備與裝置，建有電工、電子、電機、自控、檢測、單片機、PLC、電力系統(tǒng)自動化實驗室，這些實驗室為院內(nèi)外各類學(xué)生、研究生的培養(yǎng)和各項科研工作的開展創(chuàng)造了良好的條件。同時承擔(dān)勞動部中高級維修電工等職業(yè)資格證書的考核與鑒定。
不斷加強與企業(yè)間的合作，與天富熱電股份有限公司共建了實習(xí)基地，為專業(yè)人才的培養(yǎng)、職業(yè)資格鑒定、各項科研工作的開展創(chuàng)造了良好的條件。