1996年，美國農(nóng)民在主要大田作物生產(chǎn)中開始使用含抗除草劑和抗蟲性狀的轉(zhuǎn)基因 (GE) 作物品種。截至2014年，美國90%以上面積的玉米、大豆、棉花、油菜和甜菜都是采用轉(zhuǎn)基因品種，以有助生產(chǎn)者更容易和有效地控制作物害蟲。苜蓿、甜玉米、南瓜、木瓜等作物采用轉(zhuǎn)基因品種的比例小一些。
2015年2月-3月，美國農(nóng)業(yè)部、食藥局先后批準(zhǔn)了兩個美國種植最廣的水果和蔬菜即蘋果和土豆的轉(zhuǎn)基因品種。土豆是美國種植面積最大的蔬菜作物，2014年的面積超過100萬英畝，占蔬菜農(nóng)場銷售額的15%。蘋果是美國僅次于香蕉的第二大最受歡迎的新鮮水果，2014年美國掛果蘋果樹32.2萬英畝。這兩個產(chǎn)品加入轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品行列可能加劇有關(guān)轉(zhuǎn)基因與非轉(zhuǎn)基因作物和產(chǎn)品混雜的爭議。
轉(zhuǎn)基因作物現(xiàn)廣泛用于生產(chǎn)加工食品及食品原料，如玉米片、早餐麥片、大豆蛋白質(zhì)棒、玉米糖漿、玉米淀粉、玉米油、豆油、和菜籽油。因此，穩(wěn)定的有機(jī)種植（排除轉(zhuǎn)基因種子和材料）食品小眾市場不斷擴(kuò)大，不用轉(zhuǎn)基因種子的常規(guī)方式生產(chǎn)的食品市場也應(yīng)運而生。但是，有機(jī)、傳統(tǒng)非轉(zhuǎn)基因與轉(zhuǎn)基因三種生產(chǎn)系統(tǒng)共存面臨著一些挑戰(zhàn)，因為轉(zhuǎn)基因作物生產(chǎn)因偶然授粉或供應(yīng)鏈中材料混雜可能增加有機(jī)和非轉(zhuǎn)基因生產(chǎn)商的成本。
許多美國食品零售商銷售有機(jī)食品，擁有自己的有機(jī)產(chǎn)品線，有些最近已開始建立自己的非轉(zhuǎn)基因品牌。美國零售商正在尋求額外的措施保證標(biāo)明有機(jī)和其他非轉(zhuǎn)基因的食物不含或很少含轉(zhuǎn)基因成份。許多加工商、制造商和零售商現(xiàn)在需要使用避免協(xié)議和檢測以及獨立設(shè)置的轉(zhuǎn)基因性狀意外存在容忍線。為了獲得有機(jī)和非轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的溢價，生產(chǎn)者必須使他們的作物存在轉(zhuǎn)基因材料的可能性最小化。保持轉(zhuǎn)基因差異化市場的認(rèn)證取決于諸如緩沖帶之類的措施，以保證在整個供應(yīng)鏈中非轉(zhuǎn)基因認(rèn)證作物與鄰近的轉(zhuǎn)基因作物和產(chǎn)品相隔離。
本報告綜合了所有三個轉(zhuǎn)基因差異化部分的數(shù)據(jù)，并比較其在美國作物生產(chǎn)方面的價值。它還檢查有機(jī)和非轉(zhuǎn)基因生產(chǎn)商用來避免轉(zhuǎn)基因物質(zhì)意外存在于產(chǎn)品流的做法，并討論了有機(jī)作物中檢測到轉(zhuǎn)基因材料時的經(jīng)濟(jì)的影響。
2012年，美國3.9億英畝耕地近一半即1.82億英畝種植的是轉(zhuǎn)基因種子。轉(zhuǎn)基因面積的90%是玉米和大豆，美國的棉花、甜菜和油菜生產(chǎn)也廣泛采用轉(zhuǎn)基因品種。與此相反的是，2012年美國只有0.6%的蔬菜面積和 0.03%的水果面積是種植轉(zhuǎn)基因品種。
2011年美國有540萬英畝按經(jīng)過認(rèn)證的有機(jī)耕作方式進(jìn)行管理，還有約過半數(shù)的農(nóng)田、牧草和牧場。雖然有機(jī)產(chǎn)品溢價很多，美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)市場局報告有機(jī)玉米和大豆的價格比常規(guī)玉米和大豆的價格一般高兩到三倍，但是2011年，美國只有0.3%（234,000英畝）的玉米面積和0.2%（132,000英畝）的大豆面積是按認(rèn)證的有機(jī)方式種植。水果和蔬菜的有機(jī)種植面積比例大一些（超過4%) ；2011年，美國有機(jī)生菜、胡蘿卜和南瓜超過總產(chǎn)量的10%。
2014年，美國農(nóng)民使用經(jīng)過認(rèn)證的非轉(zhuǎn)基因種子種植了640萬英畝玉米和510萬英畝大豆。2012年大約59%的非轉(zhuǎn)基因常規(guī)大豆生產(chǎn)者在非轉(zhuǎn)基因認(rèn)證的市場上出售他們的非轉(zhuǎn)基因大豆。在非轉(zhuǎn)基因認(rèn)證市場出售非轉(zhuǎn)基因大豆（食品和飼料）的受訪者說，他們平均溢價2.50美元/蒲式耳，比美國農(nóng)業(yè)部報告的2012年所有大豆的平均價格高18%。美國農(nóng)業(yè)部最近開始出版一個非轉(zhuǎn)基因價格報告，顯示2015年第四季度非轉(zhuǎn)基因食用大豆溢價0.75美元/蒲式耳，比所有大豆高8-9%；非轉(zhuǎn)基因飼料大豆溢價1.13 美元/蒲式耳，比所有大豆高12-14%。
有機(jī)和常規(guī)非轉(zhuǎn)基因玉米和大豆生產(chǎn)的挑戰(zhàn)之一是防止與轉(zhuǎn)基因作物和花粉的意外混雜，以保護(hù)其溢價。有助降低混雜風(fēng)險的最好措施是緩沖帶，這一措施也能減少農(nóng)藥漂移的風(fēng)險。美國農(nóng)業(yè)部的調(diào)查年顯示69%的有機(jī)玉米和大豆面積有緩沖帶。許多有機(jī)玉米生產(chǎn)者延遲播種以減少他們的作物在同一時間與附近轉(zhuǎn)基因作物授粉的可能性。2010 年有機(jī)玉米生產(chǎn)者的平均播種日期比常規(guī)玉米生產(chǎn)者是晚2周-4周。雖然推遲播種有助于防止混合轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因花粉混雜，它這可能導(dǎo)致產(chǎn)量降低。
2014年，有報道說，美國20個州所有認(rèn)證的有機(jī)農(nóng)場主中有1%的農(nóng)場主由于2011年-2014年期間的轉(zhuǎn)基因混雜，遭受了610萬美元的經(jīng)濟(jì)損失（還不包括采取預(yù)防措施的開支和檢測費用）。有機(jī)農(nóng)場主遭受經(jīng)濟(jì)損失的比例會更高一些，因為只有9個轉(zhuǎn)基因作物的有機(jī)農(nóng)場被計算，（由于數(shù)據(jù)的局限性和保護(hù)受訪者隱私的原因，有些具體估值可能沒有報告）。雖然加利福尼亞州、印第安納州、緬因州、明尼蘇達(dá)州和密歇根州所有有機(jī)農(nóng)場主中只有不到1%的農(nóng)場主因其作物中意外存在轉(zhuǎn)基因材料而遭受損失，但伊利諾伊州、內(nèi)布拉斯加、俄克拉荷馬州遭受損失的比例達(dá)到6-7%。
本研究分析了美國農(nóng)業(yè)部幾個生產(chǎn)者調(diào)查的作物生產(chǎn)數(shù)據(jù)和措施，包括農(nóng)業(yè)資源管理調(diào)查（ARMS）、農(nóng)業(yè)部年度種植面積調(diào)查和2014 年全美有機(jī)生產(chǎn)者調(diào)查。農(nóng)業(yè)資源管理調(diào)查收集了美國主要農(nóng)場有關(guān)生產(chǎn)措施、成本、回報的詳細(xì)信息。2005年，經(jīng)濟(jì)研究局在農(nóng)業(yè)資源管理調(diào)查中開始定期增加來自有機(jī)生產(chǎn)者的目標(biāo)樣本，以使有機(jī)部門可以進(jìn)行可靠的統(tǒng)計分析。2010年農(nóng)業(yè)資源管理調(diào)查在有機(jī)玉米方面，包括目標(biāo)有機(jī)樣本和轉(zhuǎn)基因檢測和儲運排斥等問題。2012年農(nóng)業(yè)資源管理調(diào)查在大豆方面包括非轉(zhuǎn)基因大豆生產(chǎn)和銷售等問題。還從幾個私立機(jī)構(gòu)也得到了一些有機(jī)和非轉(zhuǎn)基因常規(guī)產(chǎn)品的數(shù)據(jù)。美國有機(jī)食品零售估計值基于營養(yǎng)商業(yè)雜志的數(shù)據(jù)，非轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品銷售估值來自私人財團(tuán)“非轉(zhuǎn)基因檢測” 提供的數(shù)據(jù)，該機(jī)構(gòu)為大多數(shù)非轉(zhuǎn)基因標(biāo)識零售產(chǎn)品提供檢測服務(wù)